MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia peacockii str. Rustic plasmid pRPR

Total Repeats: 639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012732	GGT	2	6	43	48	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012732	GGC	2	6	64	69	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012732	GGAGGC	2	12	70	81	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012732	TTG	2	6	92	97	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012732	CTT	2	6	173	178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012732	TAG	2	6	268	273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012732	CTTG	2	8	277	284	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012732	ATT	2	6	326	331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012732	AGT	2	6	332	337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012732	TAC	3	9	353	361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012732	AGTA	2	8	439	446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012732	TACT	2	8	467	474	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012732	T	6	6	516	521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012732	TAA	2	6	572	577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012732	T	6	6	581	586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012732	TTA	2	6	604	609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238651160
17	NC_012732	TTTA	2	8	616	623	25 %	75 %	0 %	0 %	238651160
18	NC_012732	TAA	2	6	629	634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651160
19	NC_012732	ATT	2	6	637	642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238651160
20	NC_012732	TAT	2	6	671	676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238651160
21	NC_012732	AAT	2	6	679	684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651160
22	NC_012732	TAA	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651160
23	NC_012732	AGG	2	6	723	728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238651160
24	NC_012732	ACT	3	9	739	747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651160
25	NC_012732	CTA	2	6	749	754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651160
26	NC_012732	CAA	2	6	778	783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238651160
27	NC_012732	GT	3	6	790	795	0 %	50 %	50 %	0 %	238651160
28	NC_012732	CTG	2	6	821	826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238651160
29	NC_012732	TA	3	6	868	873	50 %	50 %	0 %	0 %	238651160
30	NC_012732	TAG	2	6	878	883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238651160
31	NC_012732	ATA	2	6	893	898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651160
32	NC_012732	GAA	2	6	913	918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238651160
33	NC_012732	A	6	6	925	930	100 %	0 %	0 %	0 %	238651160
34	NC_012732	AG	3	6	970	975	50 %	0 %	50 %	0 %	238651160
35	NC_012732	CAC	2	6	1013	1018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238651160
36	NC_012732	TAG	2	6	1049	1054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238651160
37	NC_012732	TA	3	6	1108	1113	50 %	50 %	0 %	0 %	238651160
38	NC_012732	TTG	2	6	1215	1220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238651160
39	NC_012732	TTA	2	6	1221	1226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238651160
40	NC_012732	CTA	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651160
41	NC_012732	TAA	2	6	1313	1318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651160
42	NC_012732	T	6	6	1325	1330	0 %	100 %	0 %	0 %	238651160
43	NC_012732	A	6	6	1343	1348	100 %	0 %	0 %	0 %	238651161
44	NC_012732	GTA	2	6	1351	1356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238651161
45	NC_012732	TAG	2	6	1357	1362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238651161
46	NC_012732	A	6	6	1368	1373	100 %	0 %	0 %	0 %	238651161
47	NC_012732	ACT	2	6	1449	1454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651161
48	NC_012732	TTTA	2	8	1475	1482	25 %	75 %	0 %	0 %	238651161
49	NC_012732	ATA	2	6	1504	1509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651161
50	NC_012732	AG	3	6	1510	1515	50 %	0 %	50 %	0 %	238651161
51	NC_012732	TCAG	2	8	1533	1540	25 %	25 %	25 %	25 %	238651161
52	NC_012732	AT	3	6	1576	1581	50 %	50 %	0 %	0 %	238651161
53	NC_012732	CA	3	6	1601	1606	50 %	0 %	0 %	50 %	238651162
54	NC_012732	AGC	2	6	1630	1635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238651162
55	NC_012732	CTA	2	6	1695	1700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651162
56	NC_012732	TAA	2	6	1702	1707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651162
57	NC_012732	T	7	7	1732	1738	0 %	100 %	0 %	0 %	238651162
58	NC_012732	TGC	2	6	1750	1755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238651162
59	NC_012732	T	8	8	1765	1772	0 %	100 %	0 %	0 %	238651162
60	NC_012732	ATA	2	6	1779	1784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651162
61	NC_012732	AG	3	6	1829	1834	50 %	0 %	50 %	0 %	238651162
62	NC_012732	TAAAT	2	10	1846	1855	60 %	40 %	0 %	0 %	238651162
63	NC_012732	CAA	2	6	1910	1915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238651162
64	NC_012732	AGC	2	6	1921	1926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238651162
65	NC_012732	TAT	2	6	1948	1953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238651162
66	NC_012732	AT	3	6	1984	1989	50 %	50 %	0 %	0 %	238651162
67	NC_012732	A	6	6	2012	2017	100 %	0 %	0 %	0 %	238651162
68	NC_012732	A	6	6	2046	2051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012732	CGGA	2	8	2119	2126	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_012732	TAA	2	6	2137	2142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012732	CAT	2	6	2154	2159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012732	AGA	2	6	2160	2165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012732	A	6	6	2165	2170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012732	AAT	2	6	2181	2186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012732	GAT	2	6	2200	2205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012732	AGTA	2	8	2209	2216	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012732	TACT	2	8	2237	2244	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_012732	TAA	2	6	2350	2355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012732	CAA	2	6	2358	2363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012732	CAA	2	6	2378	2383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012732	T	7	7	2433	2439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012732	TTC	2	6	2462	2467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012732	AGG	2	6	2483	2488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012732	TAAA	2	8	2555	2562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012732	ATG	2	6	2563	2568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012732	ATT	2	6	2668	2673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012732	A	6	6	2691	2696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012732	GAT	2	6	2722	2727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012732	TAA	2	6	2733	2738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012732	ACC	2	6	2744	2749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_012732	AATT	2	8	2750	2757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012732	AAT	2	6	2767	2772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
93	NC_012732	ACA	3	9	2836	2844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238651163
94	NC_012732	TGA	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238651163
95	NC_012732	ACT	2	6	2894	2899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651163
96	NC_012732	TTA	2	6	2939	2944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238651163
97	NC_012732	ATA	2	6	2954	2959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
98	NC_012732	AAG	2	6	3002	3007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238651163
99	NC_012732	TTC	2	6	3025	3030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238651163
100	NC_012732	TTG	2	6	3048	3053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238651163
101	NC_012732	GTA	2	6	3084	3089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238651163
102	NC_012732	A	6	6	3155	3160	100 %	0 %	0 %	0 %	238651163
103	NC_012732	ATC	2	6	3229	3234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651163
104	NC_012732	TGA	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238651163
105	NC_012732	CTA	2	6	3351	3356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651163
106	NC_012732	AC	3	6	3365	3370	50 %	0 %	0 %	50 %	238651163
107	NC_012732	TCT	2	6	3375	3380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238651163
108	NC_012732	TAT	2	6	3391	3396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238651163
109	NC_012732	TAA	2	6	3459	3464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
110	NC_012732	ATA	2	6	3471	3476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
111	NC_012732	TAAG	2	8	3477	3484	50 %	25 %	25 %	0 %	238651163
112	NC_012732	GAT	2	6	3569	3574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238651163
113	NC_012732	TAA	2	6	3649	3654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
114	NC_012732	CAA	2	6	3655	3660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238651163
115	NC_012732	AGA	2	6	3673	3678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238651163
116	NC_012732	AGA	2	6	3700	3705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238651163
117	NC_012732	AT	3	6	3715	3720	50 %	50 %	0 %	0 %	238651163
118	NC_012732	A	6	6	3802	3807	100 %	0 %	0 %	0 %	238651163
119	NC_012732	A	6	6	3824	3829	100 %	0 %	0 %	0 %	238651163
120	NC_012732	ATA	3	9	3837	3845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
121	NC_012732	ATA	3	9	3851	3859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
122	NC_012732	AAAG	2	8	3860	3867	75 %	0 %	25 %	0 %	238651163
123	NC_012732	TAA	2	6	3868	3873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
124	NC_012732	GAA	2	6	3893	3898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238651163
125	NC_012732	A	6	6	4006	4011	100 %	0 %	0 %	0 %	238651163
126	NC_012732	AAT	2	6	4057	4062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
127	NC_012732	ATA	2	6	4089	4094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
128	NC_012732	ATAAA	2	10	4107	4116	80 %	20 %	0 %	0 %	238651163
129	NC_012732	AAT	2	6	4124	4129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
130	NC_012732	CAT	2	6	4155	4160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651163
131	NC_012732	TAC	2	6	4290	4295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651163
132	NC_012732	CA	3	6	4406	4411	50 %	0 %	0 %	50 %	238651163
133	NC_012732	GAAA	2	8	4447	4454	75 %	0 %	25 %	0 %	238651163
134	NC_012732	AAGA	2	8	4522	4529	75 %	0 %	25 %	0 %	238651163
135	NC_012732	ATA	2	6	4602	4607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
136	NC_012732	AGCG	2	8	4646	4653	25 %	0 %	50 %	25 %	238651163
137	NC_012732	TAT	2	6	4706	4711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238651163
138	NC_012732	AGG	2	6	4716	4721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238651163
139	NC_012732	ATG	2	6	4737	4742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238651163
140	NC_012732	TCA	2	6	4859	4864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651163
141	NC_012732	AGA	2	6	4900	4905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238651163
142	NC_012732	CAA	2	6	4992	4997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238651163
143	NC_012732	ACT	2	6	5025	5030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651163
144	NC_012732	AG	3	6	5070	5075	50 %	0 %	50 %	0 %	238651163
145	NC_012732	GATAT	2	10	5085	5094	40 %	40 %	20 %	0 %	238651163
146	NC_012732	A	6	6	5117	5122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012732	A	7	7	5135	5141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012732	ATA	2	6	5149	5154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012732	CTA	2	6	5166	5171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_012732	AG	3	6	5173	5178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012732	ACA	2	6	5235	5240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_012732	A	6	6	5252	5257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012732	ATT	2	6	5265	5270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012732	AAGA	2	8	5297	5304	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_012732	CAAA	2	8	5324	5331	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_012732	AAG	2	6	5332	5337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_012732	A	8	8	5388	5395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_012732	TAA	2	6	5446	5451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_012732	A	6	6	5566	5571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_012732	AATT	2	8	5629	5636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_012732	CAAA	2	8	5654	5661	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
162	NC_012732	TA	3	6	5710	5715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_012732	TTG	2	6	5719	5724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_012732	AG	3	6	5765	5770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
165	NC_012732	TGA	2	6	5783	5788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_012732	A	6	6	5804	5809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_012732	TTA	2	6	5830	5835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_012732	TAT	2	6	5885	5890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_012732	GAAA	2	8	6038	6045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
170	NC_012732	AAG	2	6	6054	6059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_012732	T	6	6	6072	6077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_012732	AAG	2	6	6116	6121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_012732	AAG	2	6	6130	6135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_012732	CCTG	2	8	6153	6160	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
175	NC_012732	ATA	2	6	6252	6257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_012732	A	6	6	6288	6293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_012732	TTAT	2	8	6321	6328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_012732	AGA	2	6	6364	6369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
179	NC_012732	ATTT	2	8	6378	6385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_012732	TGATT	2	10	6454	6463	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
181	NC_012732	ATTA	2	8	6517	6524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_012732	A	6	6	6555	6560	100 %	0 %	0 %	0 %	238651164
183	NC_012732	TAA	2	6	6561	6566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651164
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257	NC_012732	TGTT	2	8	10390	10397	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
258	NC_012732	AG	3	6	10483	10488	50 %	0 %	50 %	0 %	238651168
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263	NC_012732	GCAC	2	8	10728	10735	25 %	0 %	25 %	50 %	238651168
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265	NC_012732	ATCC	2	8	10761	10768	25 %	25 %	0 %	50 %	238651168
266	NC_012732	CGGAA	2	10	10814	10823	40 %	0 %	40 %	20 %	238651168
267	NC_012732	CCAC	2	8	10856	10863	25 %	0 %	0 %	75 %	238651168
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270	NC_012732	CAC	2	6	10992	10997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238651168
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272	NC_012732	T	6	6	11020	11025	0 %	100 %	0 %	0 %	238651168
273	NC_012732	CGC	2	6	11028	11033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238651168
274	NC_012732	CGG	2	6	11034	11039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238651168
275	NC_012732	ATC	2	6	11042	11047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651168
276	NC_012732	CAC	2	6	11185	11190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238651168
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